他人手里购买改合同住房且款已付清的，能否申请使用住房公积金贷款？

不可以。

㈠ 购买新建商品房住房公积金贷款：是指借款人在住房一级市场购买住房申请的贷款，俗称“新建商品房”贷款。须从开发商手里购买，且签定合同时仅支付首付款，余下部分申请使用公积金贷款，所贷款项要打给开发商；

㈡ 个人再交易住房贷款：是指借款人在住房二级市场购买住房申请的贷款，俗称“二手房”贷款。属于个人之间的交易，必须有一个过户的过程，房产证即从原来房主的名下过户到借款人名下。

改合同且付清全款的，不属于上述范畴。